سازمان مجاهدين خلق كه بعد از سركوب و دستگيري گسترده اعضايش در ابتداي دهه ۱۳۶۰ خورشيدي، مقرش را به عراق منتقل كرد، در جريان جنگ هشت ساله ايرانه و عراق، به ارتش صدام حسين كمك كرد.

اقدامي كه به عقيده بسياري از تحليلگران منجر به عدم محبوبيت گسترده اين سازمان در بين مردم ايران شده است.

اما سازمان مجاهدين خلق همكاري با صدام حسين در سركوب قيام شيعيان و كردها در اوايل دهه ۱۹۹۰ ميلادي را تكذيب مي كند.

دولت هاي ايران، عراق و آمريكا سازمان مجاهدين خلق را يك گروه تروريستي مي دانند و دولت عراق، كه در حال حاضر متشكل از ائتلاف احزاب شيعي است، قصد دارد حدود ۳۵۰۰ عضو باقيمانده اين سازمان را از پايگاه اشرف در شمال بغداد بيرون كند.

قاضي محمد عبدالصاحب، سخنگوي دادگاه عالي عراق، گفت: "با توجه به شواهدي كه وقوع جنايت عليه بشريت را تاييد مي كند، دستور بازداشت ۳۹ رهبر و عضو سازمان مجاهدين خلق از جمله مسعود رجوي، رهبر اين سازمان، صادر شده است."

به گفته آقاي عبدالصاحب، دستور بازداشت مريم رجوي، همسر مسعود رجوي و رهبر شوراي ملي مقاومت، شاخه سياسي سازمان مجاهدين خلق كه مقر آن در پاريس است، نيز صادر شده است.

مهدي عقبايي، از سخنگويان سازمان مجاهدين خلق، در گفتگو با رويترز صدور دستور بازداشت را تحت فشار دولت عراق دانسته است.

آقاي عقبايي گفت: "اين تصميمي سياسي، و آخرين هديه نوري مالكي (نخست وزير عراق) به حكومت ايران است."